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锘海生命科学·2022学术沙龙系列讲座——8月24日第四场

Date:2022/8/23 13:38:14


报告时间:2022年8月24日 周三 13:00-14:00

报告主题:基于深度学习的生物图像计算分析技术与应用

腾讯会议:421-297-024



嘉宾介绍:杨戈 博士


1991年于清华大学获机械工程与自动控制双学士学位,1998年于中国科学院自动化研究所获自动控制(机器人学)硕士学位,2004年于美国明尼苏达大学获机械工程(机器人学)博士学位。2004-2008年在美国加州斯克里普斯研究所完成计算细胞生物学博士后,2009-2018在美国卡内基梅隆大学生物医学工程系和计算生物学系任助理教授和副教授。2019年入选中国科学院杰出海外人才引进计划,全职回国任中国科学院自动化研究所模式识别国家重点实验室研究员,中国科学院大学人工智能学院长聘教授。曾获美国国家科学基金青年科学家(CAREER)奖,国际生物医学图像会议(ISBI)论文奖等。主要研究方向为基于人工智能的生物医学图像处理,计算细胞生物学与药物筛选技术。目前已在国际知名学术期刊如Nature Cell Biology,Journal of Cell Biology,PNAS, Cell Reports, Bioinformatics和国际知名学术会议如AAAI, ISBI等发表论文近90篇。

 

报告介绍:

现代高性能光学成像技术为生命科学提供了大量高质量且信息丰富的图像数据,然而在对于这些图像的定量分析和信息提取方面目前还存在很多挑战。深度学习是一类采用多层人工神经网络又称深度神经网络的人工智能技术。近年来,深度学习技术在生物显微图像的定量分析和信息提取方面实现了性能的突破,解决了很多传统图像分析技术长期无法解决的问题,有力助推了当代生命科学的进展。在本次报告中,我将重点聚焦生物光学显微图像的计算分析,通过实例简要介绍相关的主要技术及其在回答基础生命科学问题,提升生物光学成像性能,以及辅助药物研发中的一些代表性应用。报告的最后我将对于未来几年相关深度学习技术的发展做出展望。


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锘海学术沙龙背景:


借助组织透明化技术和光片荧光显微技术的发展,研究者对生物组织内部的结构及生理、病理特征的观察和分析从2D提升到了3D。透明化三维成像技术利用深部组织可视化和大数据,引领科学领域的进步。


针对科学研究中组织三维成像中的重点和难点,锘海自主搭建一站式科研平台,提供从“组织透明化/染色”→“平铺光片显微镜3D成像”→“数据采集分析处理及存储”整体解决方案。同时,大力推广组织透明化及平铺光片显微镜三维成像技术和应用。2022锘海学术沙龙系列讲座,将邀请国内该领域知名专家学者做特邀学术报告,借此为致力于组织三维成像研究者提供一个共享科研成果和前沿技术,了解学术发展趋势,拓宽研究思路的机会。


2022学术沙龙系列讲座由锘海生物科学仪器(上海)有限公司主办,锘海专注于高速高分辨率3D荧光显微成像系统的研发、生产和服务,广泛应用于脑科学、肿瘤学、药物研发、干细胞研究、组织胚胎学等各个研究领域。目前已与国内外多家高水平实验室开展合作研究,并获得高质量的成像数据。


锘海LS18平铺光片显微镜

专为透明化样品设计的高速高分辨三维荧光显微镜成像系统


针对透明化样品的3D荧光成像,采用与西湖大学高亮(平铺光片技术发明人)实验室共同研制的光片显微镜Nuohai LS 18,其运用创新的平铺光片技术,克服了传统光片显微镜中空间分辨率、光学层析能力和成像视野大小之间的矛盾,从而获得均匀高分辨率的3D荧光图像,广泛应用于脑科学、肿瘤学、药物研发、干细胞研究、组织胚胎学、组织病理诊断等各个领域。


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锘海组织透明化试剂盒 Cat#:NH210701

锘海自主研发的组织透明化试剂盒依托测样服务中积累到的丰富而宝贵的经验,对各种透明化方法进行测试和比较后对试剂配方进行了精心优化,使其在组织荧光保护、样本形态维持、降低自发荧光等方面表现出非常优异的性能。能够轻松实现小鼠脑、心、肝、脾、肺、肾、胃、肠、睾丸、淋巴、胎盘、卵巢等各类组织器官的透明化,适用范围广、操作简便、速度快、效率高,是广大科研工作者的选择。


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锘海一站式科研服务

让科研变得更简单


组织透明化技术和光片荧光显微技术的发展,使研究者能从宏观到微观对生物组织内部的结构及生理、病理特征进行观察和功能性分析。锘海生物科学仪器(上海)有限公司提供完整器官的组织透明化、组织免疫荧光染色、高分辨3D显微成像以及大数据分析一体化服务,旨在通过准确、快速、多样化的一站式科研服务为每一位生命科学工作者提供个体化/定制化的解决方案。


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用于快速主动式组织透明化染色系统的新型高通量系统


SmartBatch+主动式组织透明化及染色一体机是基于 Lifecanvas公司新研发的 Clear+透明化系统迭代设计而成,高度融合原有一代主动式组织透明化SmartClear系统和主动式免疫标记SmartLabel系统所有功能,是一台功能高度集约、高通量的快速主动式透明化染色一体化设备。现在,您可以在一天内实现一次性12个小鼠脑样本的透明化或免疫标记。



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